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--- mri-sequences [2023/02/23 13:14] – jonas
+++ mri-sequences [2024/02/19 14:52] (current) – ari
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 ===== Structural =====
-==== MPRAGE ====
+==== T1-weighted ====
+=== MPRAGE ===
 High resolution, T<sub>1</sub>-weighted, structural MRI
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 | Parallel imaging         | GRAPPA \\ Acceleration factor PE: 2 \\ Reference lines PE: 24 |
-==== For Incidental Findings ====
+====T2-weighted====
+=== Turbo Spin Echo (TSE) ===
-=== TSE ===
 Quick, high (in-plane) resolution, T<sub>2</sub>-weighted, structural MRI (for incidental findings)
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 | Parallel imaging         | GRAPPA \\ Acceleration factor PE: 2 \\ Reference lines PE: 26 |
-=== TSE_FLAIR ===
+=== TSE FLAIR ===
 High (in-plane) resolution, T<sub>2</sub>-weighted, 'dark-fluid', structural MRI (for incidental findings)
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 | TE                       | 100 ms                                                        |
 | Flip angle               | 150 deg                                                       |
+===== Diffusion MRI =====
+High resolution, T<sub>1</sub>-weighted, structural MRI
+^ Parameter                ^ Value                                                         ^
+| Acquisition time         | 8 min 52 s                                                     |
+| Type                     | 2D (Axial slices)                                          |
+| b-value                  | 0, 1000                                     |
+| Number of directions     | 64 (256 possible with a larger TA)                                        |
+| FOV                      | 192 mm x 192 mm                                       |
+| Matrix                   | 96 x 96                                     |
+| Resolution               | 2 mm isotropic                                                |
+| TR                       | 7800 ms                                                       |
+| TE                       | 90 ms                                                       |
+| Flip angle               |                                                          |
+| Parallel imaging         | GRAPPA \\ Acceleration factor PE: 2 \\ Reference lines PE: 24 |
 ===== BOLD fMRI =====
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 | TE                       | 5.19 ms, 7.65 ms                                              |
 | Flip angle               | 60 deg                                                        |
+==== High Resolution Fieldmaps ====
+Fieldmaps 2 mm isotropic or higher spatial resolution. They match with High resolution fMRI sequences.
+=== Fieldmapping_2iso ===
+High resolution dual-echo fieldmap
+^ Parameter                ^ Value                                                         ^
+| Acquisition time         | 1 m 19 s                                                      |
+| Type                     | 2D                                                            |
+| Slices                   | 32                                                            |
+| Slice thickness          | 2 mm                                                          |
+| Slice gap                | 25% (0.5 mm)                                                  |
+| FOV                      | 192 mm x 192 mm                                               |
+| Matrix                   | 96 x 96                                                       |
+| Resolution               | 2 mm x 2 mm                                                   |
+| TR                       | 400 ms                                                        |
+| TE                       | 5.19 ms, 7.65 ms                                              |
+| Flip angle               | 60 deg                                                        |
+=== Fieldmapping_2iso_WholeBrain ===
+High resolution dual-echo fieldmap with whole brain coverage
+^ Parameter                ^ Value                                                         ^
+| Acquisition time         | 1 m 26 s                                                      |
+| Slices                   | 40                                                            |
+| TR                       | 437 ms                                                        |
+Other parameters are those of Fieldmapping_2iso.
+=== Fieldmapping_2iso_LargerFOV ===
+High resolution dual-echo fieldmap with larger FOV
+^ Parameter                ^ Value                                                         ^
+| Acquisition time         | 1 m 24 s                                                      |
+| Slices                   | 30                                                            |
+| FOV                      | 205 mm x 205 mm                                               |
+| Matrix                   | 102 x 102                                                     |
+Other parameters are those of Fieldmapping_2iso.
+=== Fieldmapping_1.5x1.5x2mm ===
+High resolution dual-echo fieldmap with our highest achievable in-plane resolution
+^ Parameter                ^ Value                                                         ^
+| Acquisition time         | 1 m 45 s                                                      |
+| Slices                   | 32                                                            |
+| Matrix                   | 128 x 128                                                     |
+| Resolution               | 1.5 mm x 1.5 mm                                               |                                          |
+Other parameters are those of Fieldmapping_2iso.